La présente liste faunstique est issue des principes énoncés dans Queney 2011, considérant Coléoptère aquatique toute espèce dont au moins un stade libre du cycle vital est lié à l'eau, reprenant ainsi globalement les définitions données par Jäch 1998. La nomenclature et l'ordre de présentation suivent ceux du Catalogue des Coléoptères de France et ses compléments (Tronquet et al. 2014, 2015, 2016). Nous validons également la récente révision de la sous-famille des Ochthebiinae (Villastrigo et al. 2018).
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À ce jour la faune des Coléoptères aquatiques de France métropolitaine compterait donc 690 espèces et sous-espèces, réparties en 111 genres et 22 familles (le numéro d'ordre précédant chaque espèce est simplement placé à titre indicatif pour mieux comptabiliser les espèces).