Les fleuves représentent des milieux complexes, constitués d'une mosaïque d'habitats dans laquelle des micro milieux propices à certaines espèces sont en proportions différentes selon les caractéristiques du milieu traversé par le cours d'eau. Le substrat et la végétation sont des éléments importants, tout comme la pente qui peut par endroit, générer des radiers.